噪声问题在风机盘管系统中，有时一开机就会产生令人烦躁的噪声，从而使整个系统的运行状况极不正常。造成这种现象的原因通常是由于风机盘管选配不当，噪声源自于风机产生的声功率级及百叶风口的气流噪声。特别在一些宾馆客房中，风机盘管的噪声常常导致客人的投诉。
在设计施工中，应尽量选用低噪声风机，在满足风量风压前提下，适当选择低转速的风机，以降低其空气动力噪声。对一些需求较高的房间，可在风机盘管的出风口做消声处理或添加消声装置，在安装时还要注意做好减震及找平等工作。
2回风过滤问题许多采用风机盘管系统的房间，在第1～2年空调效果很好，3年以后冷量下降很多，室温无法降下来。经调查，原因是回风口未装空气过滤网。
由于风机盘管系统为湿工况运行，若回风未过滤，空气中含尘量较高，空气中的灰尘或其它细小纤维，遇上潮湿的盘管就会沾在上面，很难清理，久而久之，导致盘管热交换效率降低，使室温无法达到设计要求。所以凡是设计卧式暗装风机盘管，在投资允许的条件下应加设空气过滤器或过滤网蒸发器靠铝翅片来换热的，室内空气中含有水份、灰尘、微生物、细菌等微粒，从吸风口吸入。首先，经过过滤网，有近20%大的尘粒被过滤网所吸附。而80%的细小尘埃、细菌等微粒，在经过铝翅片细小缝隙时（1mm间隙，65mm厚度），由于翅片凉而空气热，在翅片表面产生了滴露，空气中的微粒都被粘附在铝翅片的表面，日积月累形成了厚厚的污垢，大大降低了热效率，达不到额定值。我们的维修技工会遇到运行了两至三年的风机盘管开高速档而无效果，发现电机及风轮运行正常，且能达到额定转速，探测出风口（散流器）无风。
3主机及末端设备过滤器堵塞
4维护：风机盘管经常出现的毛病通常有三个：
A.温度调不起来：电系统、水系统、风系统。其中关键是盘管热交换能力丧失（铝翅太脏或滤网堵塞）；水管内有空气，形成“气堵”现象；
B.漏水；
C.噪音超标。
